治疗主要有药物治疗和手术治疗两种治疗方式，药物治疗的目的主要是抑制卵巢功能，造成假孕或假绝经状态等。轻微的可以药物控制严重的需要手术治疗。可以选择是微型电子腹腔镜治疗。
由于子宫内膜异位结节的生长位置不同，所以其治疗方法就会有很大差异。通常需要考虑在月经干净后，行腹部切口的切开手术，将结节进行剥离切除。如果异位结节是在大网膜上，那这时就需要考虑行开腹手术，或者是腹腔镜手术，将大网膜上的异位结节直接切除。
子宫内膜异位症结节痛可以一些应用孕激素类药物治疗异位内膜停止活动，平时要多注意休息，保持良好心态，以清淡的饮食为主，不要食用腥辣生冷的食物，多吃新鲜的蔬菜和水果。
子宫内膜异位症结节痛可以吃一些孕激素类的药物进行治疗，如果药物治疗不起效果就需要手术治疗。在手术以后可以用消炎的药物预防一下感染，平时注意切口周围的清洁卫生，不要过度劳累，定期去医院复查恢复的情况。
西药治疗：通常包括促性腺激素释放激素激动剂，可令异位子宫内膜组织萎缩，从而达到治疗目的。手术治疗：切除内膜异位病灶，有的甚至切除子宫、卵巢；适用于药物无效的重症者。放射治疗：通过X光等破坏卵巢组织来消除卵巢激素的影响，使异位的内膜萎缩，达到治疗的目的。
子宫内膜异位症就必须采取药物或手术治疗。子宫内膜异位盆腔结节是指有活性的内膜细胞种植在子宫内膜以外的位置而形成的一种女性常见妇科疾病。子宫内膜异位症的治疗方案，因病情的轻重年龄和生育情况而有所不同。