巧克力囊肿的临床表现，巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的。子宫肌瘤可能和内分泌有关。巧克力囊肿的临床表现，主要是治疗方法有药物治疗和手术治疗两种，其治疗原则是，对有生育要求的年轻妇女一般采用药物治疗。巧克力囊肿的临床表现，若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用手术治疗。
巧克力囊肿的症状有月经量增多、痛经、有血块。会出现经期下腹部疼痛且疼痛逐渐加剧。手术治疗是比较好的治疗方式，药物可以抑制病情，不能彻底的治好，对于巧克力囊肿，应该考虑手术，治疗时要谨遵医嘱，根据个人的身体情况，制定专门的治疗方案。
如果有卵巢巧克力囊肿，症状主要是小腹不适，小腹疼痛，有一个坚实而无痛的肿快；白带异常，色黄异味；月经失常；有时性生活会疼痛；由于会影响卵巢分泌的激素，导致激素的含量变化，导致女性毛体增多以及引导不规则的流血。
痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。性交疼痛也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。还有不孕及月经失调。
卵巢巧克力囊肿病人，由于经期时囊肿内出血较多，囊腔内压力增高，囊壁可出现小的裂缝并有极少量血液渗漏，但裂缝很快被漏出物引起的腹膜局部炎症反应和组织纤维化所闭合，巧克力囊肿的临床表现并导致卵巢与邻近的子宫和肠壁粘连，往往也累及输卵管，所以输卵管管腔可能通畅，但管壁因扭曲而影响其蠕动，盆腔内广泛的粘连和输卵管蠕动减弱，以致影响卵子的排出和摄取，可以出现不孕。
卵巢巧克力囊肿又称卵巢内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症中最常见的一类。卵巢巧克力囊肿的女性主要可表现小腹疼痛、小腹不适、白带异常、月经失常，有时性交会发生疼痛。出血卵巢巧克力囊肿治疗：饮食宜吃羊血、螺狮、淡菜、乌贼、荠菜、藕、蘑菇、马兰头、石耳、榧子、柿饼。卵巢巧克力囊肿治疗：饮食宜多吃具有抗肿瘤作用的食物：鲎、海马、鳖、龙珠茶、山楂。