有可能会恶变的，子宫内膜异位症的三种临床分型，第一种巧克力囊肿，第二种叫做子宫肌腺症，第三种深度结节。有的病人可能这三种类型都有，对于第二种，是不可能会发生恶变的。第一种和第三种恶变率很低，因此，对子宫内膜异位症不要存有过多的担心，但是还是及时去医院进行确诊治疗。
子宫内膜异位是一种良性疾病，很少会发生恶变。所以病人得了子宫内膜异位症，也不要太担心，到正规的医院进行治疗，如果疼痛比较严重，可以选择手术治疗，做完手术以后病人休息一段时间就会好的，很少有复发的可能。得了子宫内膜异位的病人也要注意多休息。
卵巢子宫内膜异位囊肿的恶变率很低，子宫内膜异位症的恶变类型以卵巢子宫内膜样癌、透明细胞癌的组织学类型为多见。恶变的发生机制尚未明了，与遗传等有关，其本质就是个分子事件，由其本身生物学特性决定。尚未发现卵巢子宫内膜异位囊肿的恶变与年龄有明显的相关性。任何年龄段都有卵巢子宫内膜异位囊肿恶变的报道。
一般情况下，剖宫产会导致子宫内膜异位症的。
剖宫产可能性会导致子宫内膜异位症，绝大部分可能会出现腹部切口的子宫内膜异位症，主要表现为恢复月经以后在月经期出现局部疼痛，并且逐渐在局部形成小的结节，通过B超检查结合病史往往就能做出相应的诊断。引起子宫内膜异位原因很多，如果月经期同房，性兴奋的时候子宫收缩也会将子宫内膜组织挤入盆腔或者其他部位，导致子宫内膜异位症。
子宫内膜异位症跟月经疾病、忽略经期卫生、子宫位置不正和生殖器官异常有关系的，一定要及时接受手术治疗才可以，建议一定要及时的前往医院检查清楚，然后再接受医院的治疗才对。要在平时生活上多注意，多注意自己的身体情况。及时跟医生进行沟通，听取医生建议，进行治疗。
子宫内膜异位症通常不会危及生命，但会严重影响生活质量。
子宫内膜异位症会导致痛经，需要定期吃止疼药或注射止疼针缓解，因而影响日常学习、生活、工作。子宫内膜异位症的患者，还会出现不孕、月经异常等症状。
子宫内膜异位症通常用GnRH针剂治疗，该针剂通常作为手术前准备或术后注射4-6次，以减少复发的风险，改善生育情况。如有生育要求且病变期较晚的患者，建议注射3-4次后再考虑备孕。