随着生活水平的提高，人们在饮食上的选择更丰富多样，从日常饮食中已经可以摄取到足够的营养。并非一定要刻意养护，进食各种补品才算调理，只要保持正常作息、饮食均衡就可以了，无须过于纠结饮食的“宜”与“忌”，即使是刺激辛辣的辣椒，偶尔浅尝也并无不可。
以腹腔镜确诊、手术加上药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。治疗时需要去正规大医院。
巧克力囊肿的治疗原则是：对有生育要求的年轻妇女一般采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过，经保守性手术后仍有可能复发。病人应坚持随访并争取尽早怀孕，对40岁以上，年龄较大且无生育要求的妇女，可以切除全子宫以及一侧或双侧卵巢和输卵管。
患有巧克力囊肿要保证充分的睡眠，每天早起早睡，可以使皮肤变得更好，而且卵巢也会更健康。适量的喝红酒，红酒可以促进卵巢活性，从而提高卵子的质量。多吃豆制品，多吃一些豆腐、豆浆及豆制品，因为里面含有大量的植物蛋白，可以让卵巢更结实，卵子更健康。
生理性囊肿不需要手术，病理性囊肿通常需要手术来确认诊断并相应地治疗。去正规医院检查做B超。彩色B超，X线检查，腹腔镜检查等先进的诊断技术可用于卵巢囊肿的早期诊断。虽然卵巢囊肿易于恶变，但只要早期发现，早期发现和早期治疗都可以避免。
巧克力囊肿的护理要保证充分的睡眠：每天早起早睡，可以使皮肤变得更好，而且卵巢也会更健康。还可以适量喝些红酒：红酒可以促进卵巢活性，从而提高卵子的质量。多吃一些一些豆腐豆浆及豆制品，因为里面含有大量的植物蛋白，可以让卵巢更结实，卵子更健康。