治疗女性排卵障碍，可以内分泌紊乱入手，对有合并有内分泌紊乱疾病的病人，还要接受内分泌紊乱的治疗，在内分泌状态相对良好的时期怀孕，可以减少流产率及孕期并发症的发生。或者加强黄体功能，部分排卵异常是由黄体功能不足所致的，也需要加强黄体功能。
排卵障碍，又称为卵巢不排卵，可为无优质卵子可排或者优质卵子排不出，约占不孕的25-30%。排卵障碍除引起不孕外，还可导致月经失调、闭经、多毛、肥胖等症状。另外，长期不排卵，易发生子宫内膜癌及乳腺癌。所以对排卵障碍者应给予足够的重视，进行积极的检查和治疗。
排卵障碍可以采取手术来治疗。正常的排卵是怀孕的必须的过程，排卵障碍也就会对生育造成不良的影响，在临床上也是经常发生，造成的后果就是不孕症。平时要合理饮食，注意营养的搭配，养成良好的生活习惯，不熬夜，吸烟，酗酒等。
不排卵首先要找出来是什么原因导致出现卵巢不排卵的。如果是一个单纯的卵巢长不大。可以用一点促排卵的药物试试看，用点药物。是可以排卵的。首先要去医院找出来原因的存在。才能进行下一步很好的治疗。
排卵障碍治疗的方法：促排卵治疗：适用于有生育要求的病患，常用的促排卵药物，人类绝经期促性腺激素、促卵泡生长激素、促性腺激素释放激素，这些药物的使用应是慎重的，要在医生指导下使用，避免多胎妊娠、流产等发生。