治疗方法分药物和手术治疗，效果较好的就是手术，分为保留生育功能手术和保留卵巢功能的手术。仅切除内膜异位病灶，保留卵巢和子宫。适用于年轻、想保存生育机能者。严重会切除的子宫附件和病灶，这样就会导致彻底失去生育能力。
如果不进行正规治疗方式，子宫内膜异位并不会自己痊愈，所以如果已经确诊是子宫内膜异位，就一定要及时前往当地正规医院进行诊断和治疗，千万不能拿自己身体开玩笑。
少吃大蒜较好，平时饮食注意清淡，子宫内膜异位症患者更适合轻度和稀释产品。通常可以食用家禽，牲畜，蛋奶和鲜鱼，血液和血液较少的人可以更好地益气和滋补血液。蜗牛，蟋蟀，螃蟹和乌龟应少吃。
应多吃海带，鱿鱼，草鱼，紫菜，甜瓜，黄瓜，菠菜，芹菜，白菜，鹌鹑蛋，瘦肉，木耳，紫苏，深绿色蔬菜，胡萝卜，蘑菇，油菜花菜，花椰菜，卷心菜，萝卜，西兰花，亚麻籽油，核桃，南瓜子，亚麻籽等。
一般如果医生没有明确说明，食物都是可以吃的，但是辛辣刺激的不能吃，含有雌激素的药物，还是要慎用的。多吃一些蔬菜水果是很好的，严重的子宫内膜异位症，含雌激素的任何药物都不能吃。
子宫内膜异位症使用艾灸治疗的效果是不明显，但是这些女性可以通过艾灸治疗的方法来增强体质，减少子宫内膜异位症对身体造成的伤害。子宫内膜异位症的女性尽量是使用手术或者是药物的方法来进行治疗。