性交疼痛，当存在于阴道穹窿部异位子宫内膜，或卵巢粘连在盆底时候，都可能产生性交疼痛。巧克力囊肿患有不孕，大多是因为病变造成盆腔粘连、输卵管堵塞卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起的。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，白带增多、色黄或是有异味有的时候也可出现白带夹有血丝的症状，尤其是会出现性前时疼痛出血等症状。发现有这些症状尽早去医院就诊，避免病情加重。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，随着病情的发展，可能会出现持续性下腹疼痛，月经失调，不孕子宫内膜发生因为比较明显的症状就是痛经。在性生活时会出现性交疼痛，这也是巧克力囊肿中表现出的一个特征。
巧克力囊肿又叫卵巢子宫内膜异位症，应该生长，在宫腔的子宫内，膜异位到卵巢上，而形成的异位囊肿。临床的主要表现为痛经，同房疼痛，继发性不孕，这些疼痛的表现主要表现为进行性的加重，如果异位囊肿比较大，出现破裂，那么有可能会出现急性腹痛等急腹症的情况。
