一般情况下，子宫内膜异位的处理方式如下：
1、妊娠分娩是最好的治疗手段，在怀孕和哺乳期间可以起到压制作用，防止内异症，压制病灶，使病灶萎缩、吸收；
2、如果患者无痛经、短期内无生育要求、盆腔B超无包块等症状，可以进行常规的随访，一般是半年或一年一次的妇科或B超；
3、对于疼痛明显、B超包块大、有生育需求但又不能怀孕的患者，应采取外科、探查、术后用药等措施。
子宫内膜异位最佳怀孕方法是手术治疗。
如果出现一个六七厘米以下的卵巢囊肿，可以考虑是自然妊娠半年，如果不成功，可以进行促排卵或者手术。术前要进行AMH检查，以了解卵巢的功能，如果卵巢功能正常，可以选择手术。为了防止术后出现的卵巢功能减退和排卵异常，可以在术前进行冰冻。术后要尽快进行促排卵，或者去专业的不孕专家进行体外受精。
子宫内膜异位症是由子宫内膜生长异常所致，子宫内膜通常在子宫腔内，如果生长在宫腔以外的地方并且有疼痛发生，就被称为子宫内膜异位症，子宫内膜会引起痛经，所以可以药物调理，要是严重还要手术治疗。
建议采用中药治疗，中医认为子宫内膜异位症属“痛经”、“月经失调”、“症瘕”、“不孕”等范畴。本病的发生肾虚是本(性激素失调)，是为内因，故治上宜活血化瘀，益肾调本，调整机体的内环境，祛除产生该病的内因。
当子宫内膜异位出现增长或是病灶处感染的时候是最适合手术的时间，手术治疗，是切除内膜异位病灶，如果比较严重的情况下有可能是切除子宫、卵巢等，所以一定要及时治疗以免加重病情。
子宫内膜异位症的最佳治疗方法，有药物治疗，还有手术治疗。如果在临床检查过程中发现卵巢上发生了巧克力囊肿，并且体积比较大，需要做手术治疗。如果是单纯的痛经，没有发现包块与结节，可以利用药物治疗，是一种雄性激素的药物，效果比较好，需要1个月皮下注射1次，非常方便。
