对于密集的较小的纳氏囊肿或比较大的囊肿，可考虑光疗、激光、微波、自凝刀等物理治疗。对于较大的突出于宫颈表面的，可考虑电刀切除治疗。对于散在的比较小的宫颈腺囊肿不需治疗，只要每年检查即可。
宫颈囊肿可通过以下方法治疗：
宫颈囊肿是慢性宫颈炎的一种表现，患者多表现为在宫颈表面突出多个大小不一的青白色囊泡，内含黏液。根据囊肿严重程度的不同，选择的治疗方式也会有所不同，比如患者是轻度的囊肿，并且没有任何临床症状，这种情况一般是不需要进行特殊治疗的。但如果患者的囊肿较为严重，则需要考虑进行手术切除的方式来治疗。
行TCT检查，若只是提示轻度炎症，则无须治疗，平时注意个人卫生和性生活卫生，每年复查一次TCT就可以了。若是严重了，就可以行手术治疗，可以先将其刺破，之后再用激光，冷冻等方法将其烧掉。
冶疗宫颈囊肿的方法是微米光、射频消融仪等。另外远红外线光照和波姆光疗的使用也比较普遍。相对来说是BBT射频消融术，不影响生育、痛苦小，副反应少，并发症极低。也可选微波，自凝刀等物理疗法。
轻微的宫颈囊肿可以采取药物治疗，中成药效果还不错，同时还要阴道给药配合治疗；严重一点的可采取物理治疗，如冷冻、激光，或者是利普刀手术。平时房事要注意，不要过度频繁，事后注意卫生。
能，可以做微波进行治疗，治疗的较好时期是月经干净后3至7天，治疗以后需要吃上消炎药和止血药，禁同房盆浴六周，可能是同房不洁引起的，以后是需要注意同房前后男女双方都要清洗生殖器，预防炎症再次复查，经期期间避免同房。