常见的方法有保守治疗和手术治疗，保守治疗主要分为抗炎和中药灌肠或口服，抗炎主要用于输卵管积水伴有腹痛、发热。中药灌肠或者口服主要用于无腹痛、无发热的慢性输卵管积水。手术主要用于有生育要求的和输卵管积水较严重，保守治疗不理想。
输卵管积水易引起粘连、堵塞，严重者可导致不孕，临床上多通过腹腔镜进行检查、治疗。术后一个月可以进行性生活，增加怀孕机率，尽快达到怀孕目的。处理方案如下：分离输卵管粘连，排出积水，增加怀孕机会，但可再次粘连、积水，不可进行二次手术；辅助生殖技术：促排卵过程可产生孕激素，使输卵管与子宫接口松弛，积水倒流宫腔，易冲掉种植的胚胎，降低试管婴儿的成功率；通过输卵管造口可排出积水，提高试管婴儿成功率。
如果输卵管的近端是通畅的，但是远端有积水，这时候就可以采取卵管造口术治疗，可以在很大程度上恢复输卵管的功能，目前进行卵管造口术的方法有开腹手术，也有腹腔镜手术。
双侧输卵管有积水，应该考虑是慢性炎症刺激导致的。是一个慢性炎症状态，通过饮食疗法并没有很好的效果，但是平时应该注意，避免辛辣的饮食。可以口服消炎药一段时间，也可以局部物理治疗和中药灌肠。
输卵管积水采用国际先进的输卵管镜、宫腔镜、腹腔镜三镜联合技术直接作用于病变部位疏通生殖通道，技术无痛苦、恢复快、受孕率高。手术时间及费用需根据输卵管病变程度来定。
输卵管积水可药物治疗，积极治疗阴道炎，盆腔炎等妇科疾病，可理疗，远的外线照射，热敷局部等，注意休息，减少房事，保持良好心态，可以做中药灌肠进行治疗，还可手术治疗。