到目前为止子宫内膜异位症的发病原因还不太明确，可选择保守治疗和手术治疗，需要到专业妇科医院进行检查，明确病因病情，再根据检查结果选择科学的针对性治疗方法，还需要保持良好的心态积极配合治疗。
多数情况下，轻度的子宫内膜异位症会导致病人出现阴道出血、尿频尿急、肛门坠痛等症状，可以通过服用口服避孕药、孕激素等药物来进行治疗。除此之外，适当地服用中药也可以起到非常好的治疗效果。
女性出现子宫内膜异位症，大部分是因为经血流出不畅，有子宫内膜逆流入盆腔内引起的。还有一部分女性是在做完刮宫或者是人流或者分娩之后，子宫内膜发生损伤导致的。女性如果没有生育计划，要采取必要的避孕措施，避免宫腔操作，诱发子宫内膜异位症现象的出现。
子宫内膜异位症西医治疗方法有手术和药物两种：药物治疗，主要是口服激素，即假孕和假绝经疗法。手术治疗。用中医的辨证施治方法，使异位的包块要逐渐的液化。缩小、吸收，异位包块的缩小而减轻，或者全部消失。
子宫内膜异位食疗在日常生活种可以多吃含n-3脂肪酸的鱼类，而且有些深海鱼含有11-3脂肪酸，也可以多吃雪菜，这些食物的物质能够有效的抑制前列腺素的产生，是一种天然的抗前列腺素的食物，吃起来更有益。
治疗方法分药物和手术治疗，效果较好的就是手术，分为保留生育功能手术和保留卵巢功能的手术。仅切除内膜异位病灶，保留卵巢和子宫。适用于年轻、想保存生育机能者。严重会切除的子宫附件和病灶，这样就会导致彻底失去生育能力。