由于某种原因，导致性染色体不分离，形成的合子就只有一条染色体；或在分裂过程中，X染色体短臂断裂或丢失。性染色体数目或结构异常，即可出现卵巢发育不全，保持心情舒畅，做到乐观豁达，及时排解自己的不良情绪。
引发卵巢发育不全的原因是染色体异常导致的疾病，主要表现在身材矮小，颈璞，在预防上主要是不要近亲结婚，注意婚前检查。在饮食上要吃肉类，水果，活性乳酸菌，少吃冰冷，少吃甜食，少喝碳酸饮料等。
卵巢发育不全有以下原因：垂体问题；下丘脑性不排卵；卵巢早衰；多囊卵巢综合征，需要用药物促卵泡发育。去正规医院妇科检查出病因，遵医嘱用药。保持良好作息，不要熬夜。可以适当锻炼，增加下自身素质。
小儿先天性卵巢发育不全可能是染色体异常、早产等原因引起的。小儿先天性卵巢发育不全的发生是由于在细胞减数分裂或有丝分裂时，完全或部分丢失1条X染色体，从而导致染色体异常，从而导致卵巢发育不全。此外如果患儿是早产儿，可能在卵巢发育没有完全的时候产出，也会造成小儿先天性卵巢发育不全。建议家长及时带孩子去医院治疗，以免影响孩子的生长发育。
生物因素：当以病毒处理培养中的细胞时，往往会引起多种类型的染色体畸变，包括断裂、粉碎化和互换等。以转化病毒感染可使二倍体细胞转变成非二倍体，与此同时还出现了另一特殊现象-培养中的细胞群体，原来的生命期是有限的，而一旦被转化就能无限期地培养下去。支原体可引起染色体的变化，因而当把培养细胞用于细胞遗传学诊断时应当警惕支原体的感染。
垂体问题。卵巢发育不良原因之一，导致排卵异常的常见疾病，包括垂体泌乳素瘤、高泌乳素血症及席汉综合征等，高泌乳素水平可抑制排卵。下丘脑性不排卵原发性器质性因素、原发的功能性因素、继发性器质性病变、继发性功能性因素。卵巢早衰。