子宫内膜薄的原因有内分泌严重失调，失调就会导致体内激素失衡，使子宫内膜周期性变化紊乱，导致子宫内膜薄。多次药流，或者人流动作过重都可能引起子宫内膜薄。子宫发育畸形也是子宫内膜薄的一个原因，有的子宫造影已经不是倒梨形了，甚至是细长条，这种因先天性畸形造成的子宫内膜薄很难治疗。
一般初潮龄较迟或初潮后经量过少，第二性征出现较迟，月经后雌激素分泌不足，常见的症状有行经期短、经量极少、甚或点滴即净、色淡红、兼有头晕耳鸣、腰酸腿软、足跟痛等症状。适量的雌激素、孕激素可以在一定程度上增加子宫内膜的厚度，改善子宫内膜薄的症状；多次药流，或者人流动作过重都可能引起子宫内膜薄；子宫发育畸形也是子宫内膜薄的一个原因，但长期以来一直别人们忽略。
子宫内膜薄是雌激素偏低的原因造成的，引起雌激素过低的原因有垂体异常，糖尿病、甲亢、甲低等引起的，可以到当地三甲医院或者等级以上的医院进行检查治疗，排除病变的可能，多吃黄豆和豆制品，能补充雌激素。
内分泌失调，部分女性子宫内膜薄，是因为内分泌严重失调致体内激素失衡，使子宫内膜周期性变化紊乱所致。流产刮宫对内膜造成损伤。人流刮宫会使子宫内膜变薄。多次药流或人流时操作过重都可能引起子宫内膜薄。子宫发育畸形也会导致。
月经持续了两个星期，属于功能失调性子宫出血。在这期间注意保暖，避免着凉，不要吃生冷辛辣刺激性的食物，避免剧烈运动，注意个人卫生。少食含雌激素的食物和药物，少饮咖啡，低脂饮食，避免肥胖。
如雌激素水平偏低，孕激素不足，排卵障碍和生长激素缺乏等；内分泌失调会导致体内激素失衡，使子宫内膜周期性变化紊乱，造成子宫内膜薄。先天性畸形造成的子宫内膜薄，子宫内膜炎、多囊卵巢综合征，都有可能破坏子宫内膜的生长。