胚胎停育的原因有：就是生殖内分泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，孕激素，绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就会造成胚胎的停育。还有是生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育。还有是子宫的问题，如果是子宫的内环境不好，或者是畸形也不会发育。最后是染色体的问题，如果做检查，就要四个方面做详细的检查，还有外界环境污染辐射等因素。
黄体功能不足：支持胚胎发育的孕激素在怀孕最初8周，来自妈妈的卵巢，8周之后来自胎盘。甲状腺功能异常：除了黄体功能不足，另一个因为内分泌紊乱导致胎停育的重要原因就是甲状腺功能异常。子宫异常：先天或后天的子宫异常有很多类型，比如子宫纵膈、子宫肌瘤、宫腔粘连等，都存在导致胎停育的风险。
胎停育的发生主要是由女方引起的，所以治疗的时候以女方为主，但是也不排除男性一方的原因，若女性检查正常，或有异常，同时男性检查有异常应同时调治，只要双方进行共同治疗。
胎停育就要做全面检查，抗体检查放在最后，重点放在黄体功能、TORCH和肾脾功能，改变不良生活方式。要把检查的重心放在精子和卵子上面，通常空囊是由于精子质量不好，受精卵受到强辐射造成的。
胎停育后的女性在流产后要注意调理好自己的身体。此时女性的身体很虚弱，要注意增减营养，摄入足量的蛋白质，增强机体对疾病的抵抗力，促进子宫和卵巢的早日修复。这期间多吃些肉、鱼、鸡、蛋、乳类、大豆制品等蛋白质丰富的食品和富含维生素的新鲜蔬菜。