排卵障碍的治疗是通过诱发排卵，药物，手术等治疗方法。中西结合三期治疗，根据月经特殊生理现象，根据各阶段的变化，将药物分阶段用于中医与西医相结合，以中医药治疗为主线，个性化的特定治疗。
由于卵巢不排卵而导致的排卵障碍，一般都是因为自身没有优质的卵子或者是卵子排不出，可能需要一个月的治疗，然后再进行观察，也不能确定的给一个准确的治疗时间，因为不同的情况。治疗的时间也不一样。而且每过一段时间进行一个检查才能确定多久才能完全恢复。
导致女性出现排卵障碍的问题有内分泌紊乱，卵巢局部因素等，排卵障碍一般可以采用促排卵药物进行治疗，也可以配合中药进行调理，由于每个人的身体体质都是不同的，所以治疗的时间长的也会因为个人情况而不同。
1-2年，造成排卵障碍的因素有：中枢神经系统性无排卵；下丘脑性无排卵；垂体性无排卵；卵巢性无排卵；多囊卵巢综合征；卵泡黄素化不破裂综合征；其它：性腺以外的其它内分泌系统如甲状腺、肾上腺皮质功能失调和一些全身性疾病。
排卵障碍是常见的内分泌疾病，在不孕症中发病率可达25%—30%。其临床表现多种多样，如月经失调、多毛、肥胖、不孕等。由于长期不排卵，子宫内膜过度增生而无周期性孕激素的对抗作用，因而尚具有发展成为子宫内膜癌或乳腺癌的高度危。
排卵障碍治疗需要看病情决定。排卵障碍是女性不孕的重要病因之一，也叫不排卵。导致排卵障碍的原因有全身疾病、卵巢疾病因素和中枢性影响，治疗排卵障碍的方法有三种，一是调节情绪，二是中西医结合诱发排卵，三是腹腔镜打孔术。这三种方法都可以治疗排卵障碍。