首先肯定的是巧克力囊肿不会自己消失，如果通过检测，发现囊肿破裂，就需要警惕，会不会因为囊肿破裂而引起粘连，导致囊肿周围的健康组织遭受感染。如果发生，那么可采用手术治疗。保证身体安全，避免更大的感染，导致身体痛苦。
附件巧克力囊肿会自己消失。巧克力囊肿就是子宫里面内膜异位症的一种，属于良性肿瘤。如果其生长的速度太快，那么必要的时候就需要做手术。假如没有什么生长，那就没什么问题了，因为这种巧克力囊肿随着时间的推移也会逐渐自行消失的。
子宫内膜异位症的一种病变，这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂。治疗方面，还未生育的年轻女性一般采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。
巧克力囊肿会自己消失。良性囊肿如滤泡囊肿大都在5厘米以下3厘米左右，应观察三个月，两个月左右的时间内滤泡囊肿缩小或未增大，那么过一段时间后囊肿便会自行消失，但若囊肿继续增大，大于5厘米就必须手术治疗了。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。
巧克力囊肿怀孕后一般会有所缓解，但是不一定会消失。为了避免巧克力囊肿的发生，女性朋友在平时要做好日常的预防工作。月经期间不要进行重体力劳动，不要吃寒凉的食物，不要进行性生活，注意保暖，特别是小腹部的保暖，要做好避孕措施，避免不必要的妇科手术。
