巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
卵巢巧克力囊肿疾病最突出的症状就是痛经，会让出现经期腹痛的感觉，而且性交的时候也会有可能出现疼痛感，所以说出现疼痛的感觉就应该警惕起来，一般还会伴有不孕的症状出现，月经改变也比较明显，需要及时确诊和治疗，防止疾病加重很关键。
卵巢子宫内膜异位囊肿又名卵巢巧克力囊肿，也是较为常见的卵巢囊肿，是由于子宫内膜异位症波及卵巢在卵巢内形成含有巧克力样粘稠液体的囊肿。肿块的大小不一，大的直径可在十厘米以上。常有进行性加重的痛经、性交痛、不孕以及月经失调。妇科检查时盆腔有触痛性结节。卵巢巧克力囊肿的治疗要根据年龄、囊肿大小、痛经程度、有无生育要求等综合考虑，分别采取药物、保守性手术直至好的性手术治疗。
巧克力囊肿，会降低怀孕几率的，是手术治疗以后再怀孕比较安全。是治疗后在怀孕，以免引起怀孕几率下降。如果已经怀孕，巧克力囊肿是不会影响到胎儿发育的。如果怀孕后期没有骨盆异常可以尝试阴道分娩。
卵巢巧克力囊肿治疗后不会影响生育。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是最符合本病处理方法。平时注意休息，以清淡易消化饮食为主，避免辛辣刺激性食物。
发现患有巧克力囊肿的时候一定要积极的进行手术的方式治疗，因为手术的方式治疗卵巢巧克力囊肿是目前为止能够较为彻底地清除囊肿的一种治疗方式，而且通过手术的方式还可以有效的缓解痛经，提高生活质量，对于有不孕症的病人，手术之后妊娠率能够得以提高。