卵巢囊肿的阴超是月经干净第3天，非月经期就可以，这时候检查的子宫内膜的厚度有很高的参考价值的。是否是巧克力囊肿，这需要结合子宫内膜厚度分析的，同时还需要看囊肿的内部细节。
进行卵巢囊肿手术要在月经干净之后的第三天进行手术，如果说时间上不允许，可以延迟几天，在做完手术之后，很可能会出现了病情反复发作的情况，因此术后饮食应该要保持清淡一些，不可以吃辛辣刺激的食物，也不可以吃海鲜，同时还应该注意做好个人卫生护理工作。
卵巢囊肿在月经干净后1周内积极进行b超检查还是比较准确的，如果是生理性囊肿也可能在经期后自己消失的，所以应该定期到医院选择复查看看，看一下囊肿的大小等，或者看看是否有腹痛等不适的情况，但是在饮食方面还是需要多注意加强营养的。
治疗卵巢囊肿的时间，这个不固定的，如果两种的尺寸超过4公分，就需要积极的进行对症治疗的，卵巢囊肿多数考虑可能跟炎症或者体内的激素水平发生变化有关系，去当地正规的公立医院咨询清楚后进行检查治疗，病人要遵医嘱，不可自行进行药物治疗，并要定期进行复查，根据病情及时调整治疗方案。
在月经干净后及时到医院选择复查，平时看看是否腹痛或者伴随月经紊乱，在饮食方面还是多吃温补的食物，多观察一段时间，囊肿的发育等很可能会导致并发症的，所以必要时选择微创手术的。
通常情况下，检查卵巢囊肿的最佳时间是月经干净后两三天。具体情况分析如下：
检查是否有存在卵巢囊肿，最佳的时间为月经干净后两三天，因为在这个时间段检查，此时还没排卵，黄体还未形成，可以鉴别是卵巢囊肿还是生理性的黄体囊肿，其他时间检查，如果有也可能只是存在生理性的黄体囊肿，黄体囊肿在月经来了之后可能会自己消失，所以患者可以在月经干净后两到三天做检查，能对生理性的黄体囊肿进行区分。