子宫内膜薄但是怀孕了会不会有影响，是要看个人的情况来决定的。因为是需要去医院进行检查治疗，由于全身消耗性疾病如结核、营养不良、贫血等，或精神因素如紧张、忧郁、恐惧等以及劳累、环境改变等因素引起的。
子宫内膜薄怀孕了对胎儿有影响，首先会影响孕卵着床，容易引起流产。如果怀孕，要积极的保胎，口服保胎药及维生素e，及肌注黄体酮。怀孕三个月内禁止性生活，性生活是容易引起流产的。备孕前三个月口服叶酸，一直吃到怀孕三个月。孕11-13周做Nt检查，孕15-20+6周做唐氏筛查，孕20-24周，28-32周，做四维彩超，孕24-28周做糖耐量检查。
女性子宫内膜薄是可以导致胎儿出现胎停育、腹痛、阴道出血等先兆流产现象。子宫内膜存在一定的缺陷，可以引起怀孕之后孕囊附着的异常，如出现怀孕早期腹痛、阴道出血等先兆流产的现象。
子宫内膜过薄可以对怀孕造成不良影响，严重时可以造成流产。子宫内膜过薄会导致先兆流产或是流产，或是胎儿发育不良，甚至是胎死宫内。过薄的子宫内膜，受精卵不易着床，不能供给胎盘和胎儿足够的营养，如果流产，有导致继发性不孕的可能。
子宫内膜过薄要警惕流产的状况。孕早期可以卧床静养，吃一些保胎的药物也可以的。避免性生活，不要干重活和剧烈运动。另外少吃寒凉刺激的食物，有利于子宫内膜的增长。
子宫内膜薄现在怀孕了要注意保证自己的休息，同时避免在妊娠前三个月后三个月进行性生活。在妊娠的前三个月，胎盘的绒毛与子宫内膜的结合还不是十分的牢固，此时性生活易促使子宫收缩。