卵巢囊肿大部分是做的囊肿的剔除术，手术中难免会有出血以及手术的创伤面。若是手术中没有控制好出血量、以及创伤面，就会导致术后有感染出现。因此术后感染可以说是卵巢囊肿的第一后遗症。
术后常见并发症如盆腔组织粘连，有时候会偶有下腹坠胀、隐痛等。手术如果顺利，后遗症一般会很少多，甚至没有肌瘤处的子宫壁可能会薄一些，如果肌瘤切除干净了，就不会复发，保持好的心情，一个月以后可以去复查一下禁食辛辣刺激性生冷的食物。保持充足的睡眠，避免同房。
手术后大部分病人并没有后遗症，只存在一些短期并发症。手术后遗症可能和气腹有关系，而且在手术后气体如果不能完全排尽，那么残留的气体就会游离至右肩背，不过大部分病人都没有什么症状，只有少数病人才会引起右肩痛，不过疼痛症状在手术后的二到三天就可以自行缓解。
卵巢囊肿手术后遗症有，卵巢功能减退，卵巢早衰的出现。因为卵巢囊肿是生长在卵巢之内，手术剥除的过程会对卵巢的皮质造成影响，会影响到卵巢的功能，手术过程中不注意保护卵巢组织将正常的卵巢组织破坏太多，或切除的太多，术后容易引起卵巢早衰，需要检查性激素六项来判断。卵巢手术后盆腔粘连的，在恢复的过程中容易出现卵巢创面与大网膜或肠道组织相粘连。
卵巢囊肿切除术后遗症主要是感染和影响月经。
卵巢囊肿的手术，大部分是在做囊肿剔除术，手术中难免会出血以及手术的创面，若是手术中没有控制好出血量，以及创伤面，就会导致术后有感染的情况发生。其次可能会影响到卵巢，或者是输卵管伞端的正常功能。输卵管囊肿的手术后，由于剔除囊肿有可能会出现排卵延迟，打乱原有的排卵周期，这样就会直接影响月经的来临。
建议饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。
卵巢囊肿剥离术后遗症主要是感染和出血。
卵巢囊肿剥除术后的后遗症主要包括有术后延迟的出血、盆腔的感染、盆腔的粘连以及卵巢囊肿的再次复发等。目前在临床上常用的卵巢囊肿剥离术通常是用腹腔镜辅助的，比较少用开腹手术。腹腔镜是一种微创手术，创伤比较小，患者术中出血也少，对患者的损伤更小，恢复更快一点。
建议食用适量的蔬菜和水果，因为蔬菜和水果中包含有丰富的矿物质和维生素，可以提高自身的抵抗力，帮助伤口快速愈合。