卵巢巧克力囊肿破裂应该立马进行手术切除囊肿，术中要吸尽囊液、清除囊内物、彻底的冲刷盆腹腔；出血过多的时候，要及时给补充血液，及时手术清除囊肿，保护好卵巢、保全子宫，避免将来发生不孕。囊肿手术后，对机体机能损伤很大，一定要注意调理。
卵巢巧克力囊肿破裂后一定要及时进行治疗，一般有手术治疗和药物治疗。如果置之不理可产生严重影响，可影响月经或者生育。平时作息时间要规律，饮食上要注意清淡，不要吃辛辣刺激行的食物，注意外阴部位的卫生，勤换洗内裤，平时多注意休息。
巧克力囊肿在膨胀到一定程度后是会发生自行破裂的情况的，巧克力囊肿破裂后，小的破口可以很快自行愈合，并与周围组织形成粘连；如果破口较大，则无法自行愈合，其浓稠的巧克力样囊内液可流入腹腔，巧克力样液体的刺激性极强，可刺激周围的腹膜，引起剧烈的腹痛，如果处理不及时，还可能导致弥漫性腹膜炎。一定要及时就医。
通常巧克力囊肿大于五公分以上时，由于剧烈的活动，或者同房等原因，就可能会引起巧克力囊肿破裂，这时就会引起剧烈的下腹部疼痛。所以就必须赶紧去医院急诊就诊，然后行腹腔镜微创手术，或者直接行开腹手术，将破裂的巧囊切除，而且还要将盆腔内的巧囊液完全清洗干净。
如果巧克力囊肿已经破裂，急诊手术将破裂的囊肿切除，并且在术中尽量清洗盆腔。主要是将盆腔内破碎的囊液全部清洗干净，避免具有活性的子宫内膜细胞种植在其他脏器上，而引起子宫内膜异位症。避免囊肿的复发。主要是使子宫内膜萎缩，达到治疗子宫内膜异位症的目的，避免巧克力囊肿复发。
因为本身巧克力囊肿是因为子宫内膜异位引发的。如果没有来月经，一般不会加重病情的。用药是否有效，只有检查B超观察，囊肿是否增长只有观察无法预测，复查B超观察。忌辛辣。