导致原发闭经的原因有疾病的影响，只要疾病治好了，月经也就自然来潮殖道下段闭锁，生殖器官不健全核性子宫内膜炎及脑垂体和下丘脑功能不正常等也会造成闭经。肾上腺、甲状腺、胰腺等功能紊乱。由于这些因素的影响，常常不来月经。凡是这几种情况引起的闭经，只要疾病治好了，月经也就自然来潮。
原发性闭经是女性在14岁以上，无任何生理期和二次性征的发展，比如胸部的生长，外阴阴毛和腋毛的生长，体内的油脂增加等，如果是16岁以上，出现了二性征，没有来月经。
这是一种常见的先天缺陷或者是生殖系统的畸形，比如先天性的卵巢发育不全，大约有35%是原发性的闭经，而在这些先天性腺的发育不全中，有75%的人会有染色体异常。所以，在确诊为原发性闭经的年轻女性的同时，要进行染色体的核型检查，排除染色体异常导致的闭经。
原发性闭经是指凡妇女年满18岁或第二性征发育成熟2年以上仍无月经来潮者，引起闭经原因有两类：1.由于精神紧张压力大、药物、节食、生活不规律等导致的内分泌失调可引起月经不调，即月经病。2.器质性病变，如括生殖器官局部的炎症等。如果没有腹痛、白带异常等症状，应该不是器质性病变，同时要放松心情，减少压力，保证睡眠，适当参加户外运动。
人工流产不当。多次人工流产，或者刮宫过程中用力过猛或者操作不当都可能引起子宫内膜机械性损伤，子宫内膜失去正常的修复与增生能力，无法正常脱落，导致绝经现象产生。如果子宫内膜有大面积损伤可造成子宫前后壁粘连，有永久闭经的可能。
原发性闭经是因为生殖器官不健全造成的。天性无卵巢、卵巢损坏、或卵巢发育不良，没有雌激素、孕激素产生，导致子宫内膜无法正常周转，子宫内膜就不能脱落，也就没有月经。
正常闭经，是女性正常的生理现象，生育功能逐渐下降，直至没有生育功能。闭经很多时候如果属于病理性疾病，极有可能会造成不孕，而只要孕龄区出现异常闭经状况，则会给生育方面带来一些影响，常见病因为如下：1、基础性疾病，包括消耗性疾病或某些内分泌腺，肾上腺或甲状腺，胰腺的功能障碍，均可引起闭经。2、生殖道不正常，发育不正常，如子宫颈，阴道，处女膜和阴唇有时可发生闭锁，可出现闭经。3、为生殖器官发育不完全或不健全，如卵巢或子宫功能不健全等，均可影响月经，若存在卵巢或子宫病变时，通常可影响妊娠。
