对于妊娠时间小于等于49日的，门诊行药物流产术，一般从阴道流出组织，产科医生常规会进行检查，对于孕囊排出完整、阴道出血少者，可嘱其回家卧床休息。对于未见明显孕囊排出者，继续观察。对于出现大量阴道出血者，需急诊行刮宫手术终止妊娠。对于阴道出血少、又未见明显孕囊者，可给予复查B超，排除宫腔残留。对于妊娠时间大于49日的，一般都是住院处理，必要时也需要复查B超，排除宫腔残留。
药物流产的结局有完全流产和不全流产。完全流产，妊娠囊以及蜕膜全部排出体外，阴道一般会少量间断性的流血3到7左右后停止。如果是发生不全流产，一般会表现为阴道流血时间长，7到10天以上，不好预测多少天能流干净，如果是宫腔少量残留，有时口服缩子宫药，能够促使其排出来，阴道流血会逐渐停止。如果宫腔内残留多，一般是需要清宫治疗才能够止血。
吃了打胎药通常7-10天流干净。米索前列醇和米非司酮是打胎药物。如果是宫内妊娠，停经49天之内可以服用打胎药终止妊娠。服用药物1-2个小时后会有下腹部的不适和阴道出血的症状。孕囊排出后需要服用活血化瘀、促进子宫收缩的药物，如益母草冲剂、五加生化胶囊等，通常在7-10天可以流干净，但有少数患者在复查时发现子宫内仍然存在不均质回声，可能是药物流产不全，需要进行清宫。
一般可以通过B超、症状等方式判断流产是否干净。
通过B超检查胎儿组织有没有被清除干净，是最安全，也最可靠的方式。根据临床表现，药物流产或者人流后的阴道流血会减少，半个多星期后就会完全消失，没有任何的不适。如不能排空，则会出现早期妊娠的情况，阴道会出现大量的持续性大出血，同时还会出现下腹下坠疼痛等情况。女性自身体质较差，抵抗力较差，会导致女性出现阴道感染、盆腔炎、子宫内膜炎等妇科疾病。
在怀孕49天内可做药流，在服用打胎药后，孕囊会在六小时到一周内排出，平均2到3天排出孕囊。之后会流血15天左右，可适当服用药囊和药片。如果两周内停止流血且没有腹痛及其它不适的症状，通常就是药流干净。但这时也需要去医院复检，通过B超检查能清楚判断宫内是否有残留物。如果没有残留物，则药流成功。
药流后如果没有流干净，会出血时间长，出血多。药物流产主要适用于停经49天以内的早孕，服完药以后要观察。孕囊和子宫脱膜组织都会排出，排出干净后，子宫恢复好阴道不会再继续流血，流血持续时间3到7天。
