药物流产不干净必须要再进行清宫手术，避免引起妇科内膜炎症或者是不孕症，通过清宫手术并不会对身体产生很大的伤害，药物流产没有流干净是需要清宫的，清宫对身体有一定的伤害但是还是必须要清宫，时间久了可能还需要进行电切。
一般情况下，药物流产不干净不清宫会导致贫血、盆腔炎等问题。
药物流产如果不干净，检查发现有宫腔残留组织，一般需要尽快进行清宫处理，否则容易导致贫血、盆腔炎、子宫内膜炎等情况，严重时残留组织还可能会发生机化，进而对以后正常的月经来潮和生育造成不良影响。所以一旦出现药物流产不干净的情况，患者需要听从主治医生的建议，尽快进行清宫。
人流通常指人工流产。一般情况下，药物流产和人工流产都会对身体产生伤害，相比之下可能药物流产伤害略小一些，具体内容如下：
不管是做人工流产，还是做药物流产，都会对女性的健康造成伤害。如果一定要做对比的话，药物人流对女性身体的损伤可能会更少。药物流产主要是口服米非司酮片、米索前列醇片进行的，口服药物后，女性可能会有呕吐、腹部不适、少量的阴道出血等副作用。而人工流产是要进行手术的，手术中的操作可能会对女性的子宫内膜造成伤害，可能会出现出血、穿孔等并发症。因此，相比之下可能药物流产伤害略小一些。
一般情况下，药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的，属于正常的反应。
清宫手术的疼痛感主要是清宫时扩张宫腔带来的，在医疗器械进入宫腔内的刮宫过程也会疼痛，因此药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的。在采用无痛的清宫手术后，麻药药效过后，也会有轻微的疼痛感，但是一般在可以承受的范围内。
日常生活中女性要注意多休息，坚持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，有利于病情的恢复。
流产对身体的伤害很大，任何一次流产或者是任何方式的流产对身体均会造成一定的伤害，都有可能出现并发症，比如出血、席汉氏综合征、感染、子宫损伤、子宫穿孔致周围其它脏器的损伤、宫腔粘连、子宫内膜异位症、月经不调、继发不孕等。所以怀孕了不能轻易做流产，尤其是第一次流产，如果没有生育要求，一定要做好避孕措施。
药物流产以后，出血7天就干净了，并且宫腔里没有残留，伤害不大，大部分的药物流产，流血时间比较长，有10%左右的人出现宫腔内的残留，需要二次刮宫，对身体和子宫内膜的伤害比较大。