一种是卵巢囊肿切除术，为年轻人以及未经生育者多采用这种方式，尽可能保留正常的卵巢组织。另一种就是输卵管卵巢切除术，这个一般在45岁以上女性或绝经后的病人使用，需要对一侧或双侧输卵管卵巢进行切除手术。
如果右附件囊肿比较小，通常可以怀孕。但如果右附件囊肿比较大，可能比较难怀孕。
在出现右附件囊肿后，先要确定右附件囊肿的大小、性质。如果是非常小的囊肿，或者是生理上的囊肿，通常可以正常受孕。但如果右附件囊肿很大，有囊实性，或是混合性包块，可能比较难受孕，或容易在怀孕后出现破裂、扭转、恶变。此时，最好是进行手术治疗，以排除恶性的可能性，在术后再怀孕。
右附件囊肿有生理性的和病理性的两种，前者主要见于黄体囊肿和滤泡囊肿，黄体囊肿是在月经期后半期出现，而滤泡囊肿则多是在月经期的前半期出现，待月经干净后多会自然消失，不会对身体造成不良影响；病理性卵巢囊肿是因卵巢的上皮细胞异常增生而形成，需要在医师的指导下决定是否需要药物或手术治疗，或只需要定期复查就可以。
右附件囊肿可以使用以下方式处理，具体分析如下：
生理性黄体囊肿是正常情况下不会有什么表现，也不需要进行治疗。右附件巧克力囊肿是由子宫内膜异位引起的，一般会出现进行性加重的痛经，也有继发不孕的可能，如果囊肿大超过5厘米，需要进行腹腔镜手术。如果是正常的囊肿，不超过三公分，一般不会有什么特别的表现，可以口服桂枝茯苓丸。
患者右侧附件出现囊肿，是否需要手术需要根据患者的病情来判断。
如果囊肿直径比较小，在3cm以下，目前并不伴有阴道流血、腹部疼痛、压痛等症状，一般是不需要手术的，注意通过口服药物进行保守治疗。但是，如果患者目前的附件囊肿在逐渐增大，刺激局部腹壁肌肉引起疼痛、阴道流血等症状，为了防止囊肿破裂扭转，建议患者及时进行手术治疗。