如果药物流产能完全将孕囊排出干净，一般不需要再行清宫手术操作，药流不需要进入宫腔操作，直接通过药物让孕囊自然从宫腔内排出，所以伤害一般比较小，那么一般人流手术比药流伤害更大。因为人流手术时，一般会用负压吸引管进入到宫腔内，将孕囊和部分蜕膜组织吸出，这时会对内膜造成一定的伤害，而且在进入宫腔操作的时候，也可能会引起盆腔感染。
相对于人工流产来说，药物流产对患者的伤害并不大。
人工流产是一项有创性的手术，需要用负压吸取孕囊、血液等组织，在人工流产过程中难免会对宫腔产生伤害。而药物流产是一种可以终止怀孕的方法，是指口服药物终止早期妊娠，在药流后要到医院做B超，确定是否是子宫内怀孕后再进行药物人流。在恢复期要多休息，不要食用辣椒、大蒜等辛辣刺激的食品。
正常情况下人流伤害更大。药流和人流都是终止早期妊娠的一种方法，对身体都是有危害的。人流是通过手术器械进行宫腔负压吸引，将妊娠物吸出宫腔外，对身体损伤相对会比较大。药物流产则是通过米非司酮和米索作用人体，使妊娠物与子宫内膜剥离，并通过子宫收缩将其排出体外，对人体特别子宫内膜的损伤相对比较轻，但是如果药流流不干净的情况下，还是需要进行清宫处理，这样伤害就会比人流大。建议：平时一定要做好避孕措施，另外要注意性交卫生，控制性生活的频率，不宜太过频繁。
药流的危害小，人流的危害大。如果药物流产能完全将孕囊排出干净，而不需要再行清宫手术操作，那么一般人流手术比药流伤害更大。这是因为人流手术时，会用负压吸引管进入到宫腔内，将孕囊和部分蜕膜组织吸出，所以这时候对内膜可能会有一定的伤害，而且在进入宫腔操作的时候，也可能会引起盆腔感染。药流不需要进入宫腔操作，直接通过药物让孕囊自然从宫腔内排出，所以伤害一般比较小。建议患者到产科检查后，在医生的建议下选择最合适的人流方式。日常注意多休息，注意保暖，营养饮食，多吃鸡蛋和牛奶，增强免疫力。
药物流产和人工流产相比，人工流产对于子宫内膜和身体的损伤比较大。
人工流产采用的是负压吸引术，通过负压增加宫腔内的压力，把妊娠组织吸出来，可能会损伤子宫内膜的基底层，导致以后不来月经、月经量少或者宫腔粘连。药物流产一般是口服米非司酮和米索前列醇，通过药物的作用使子宫收缩，自然的把怀孕的组织挤压出来，没有宫腔操作，对于子宫内膜和内分泌系统的损伤最小，即使有大约15%-20%的人药流不干净，需要再做清宫，清宫手术也比人工流产术的损伤小的多。所以对于没有特殊情况的患者，一般建议选择损伤更小的药流。
药物流产适用于怀孕49天以内的，如果怀孕没有超过49天，做彩超检查可以确诊为宫内孕，就可以服用药物流产药，药物流产相对来说比人工流产对子宫内膜的损伤要小一些。但是药物流产有可能会流不干净，如果宫腔内不能彻底排干净，就需要再做清宫手术。