比较小的巧囊不建议再做手术，每次手术都会损失部分卵巢组织。建议尽早怀孕，或吃口服避孕药控制病情发展。有轻微或无症状的轻微病变应期待治疗;有生育要求的轻度患者应在明确诊断后首先进行治疗;重症患者应接受保生育手术治疗;没有生育要求的严重年轻患者应接受保留卵巢手术治疗，并辅以药物治疗;有严重症状和无生育要求的病理改变的患者应使用药物治疗。
巧克力囊肿做手术复发需要适当的注意好休息，调节好心情，到医院进行检查，同时况采取手术治疗的方法，并且应用大量的免疫抑制剂。还要防寒避湿，避免淋雨，喝冷饮等，尤其要防止下半身受凉，注意保暖。
卵巢巧克力囊肿属于盆腔子宫内膜异位症一种，有复发的风险。手术过程当中，不可能将微小的病灶全部去除，因此部分女性在术后囊肿复发。如果囊肿持续增大，需要手术治疗，配合一些药物使用。
做完巧克力囊肿手术后又复发，可以考虑用绝经的假绝经的疗法，让她不来月经，囊肿就能好一些。或者巧克力囊肿复发了，手术以后，一定打一些针，术后好好用一些药，让不来月经，假绝经疗法，去治疗巧克力囊肿。
巧克力囊肿复发可采取药物治疗或手术治疗。如囊肿不大症状轻微可予药物保守治疗，若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术。
及时去正规的医院做进一步的检查，然后根据检查结果，尽快选择合理的方法手术治疗。如果病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，病人一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
