月经干净后肚子疼腰酸的估计是妇科炎症引起的，到医院做一下分泌物B超和阴道镜方面的检查确诊一下病因情况，早期对症采取针对性治疗措施。如果是妇科炎症的需要用广谱抗生素治疗两周看有没有效果了，治疗后需要复查妇科炎症，以后注意个人卫生了那就先观察。平时不要过度劳累，好好的休息，可以做一下局部的热敷，按摩和理疗。
月经后肚子疼腰酸原因有：1、妇科炎症引起的，例如盆腔积液、宫颈炎、盆腔肿瘤、盆腔炎等；2、月经期间激素水平下降，子宫内膜增厚，通常会有子宫内膜脱落，月经过后激素水平恢复正常，恢复期间可能会引起腰酸痛的症状；3、软膏患者不注意保暖，着凉后可能也会引起腹部疼痛、腰酸等症状。
建议及时到医院做B超检查，查明原因后积极配合医生对症治疗。
腰酸肚子疼却不来月经，有性生活史，而且没有避孕，首先考虑是怀孕了，可以用早孕试纸来测试一下。如果不是怀孕，个别在月经期前出现腰酸、背痛、肚子痛、乳房胀痛、烦躁易怒、焦虑、抑郁、注意力不集中、疲乏劳累、饮食或睡眠习惯改变等现象。
月经推迟三天出现小肚子疼痛，腰酸的症状，如果患者有性生活，首先考虑可能是怀孕了，再有可能是快来月经的表现，一般月经提前或者退后一周都属于正常的。建议先检测是否怀孕，如果没有性生活史，应该就是快来月经了，注意保暖，少吃辛辣刺激性的食物，可以口服点红糖姜水，促进月经来潮。
主要是由于月经到来之前内膜增厚，体内的雌激素达到了一定的高度，所以会出现腰酸的症状，可以用温水敷腰部，注意经期不要吃过多寒性食物，注意好身体保暖，一般来月经之后就会消失。
通常情况下，女性的月经如果推迟时间处于7天之内，可能是正常的现象，此时患者受到情绪压力、饮食不当、运动不当、周围环境、服用药物等因素影响，可能还会出现小肚子疼、腰酸等症状，可能是痛经的表现，主要是受到盆腔充血、子宫内膜前列腺素增高等因素引起。如果患者的月经推迟一周时间，可能是怀孕了，并且如果小肚子疼腰酸，还需要注意出现先兆流产的可能。