月经干净后有咖啡色的分泌物，属于比较常见的现象，因为宫腔内还存在少量的出血，还没有完全的干净，一般咖啡色分泌物大概会持续两-三天，可以适当喝红糖水，促进排干净，注意个人卫生。
月经老是不干净而且有咖啡色分泌物，对于有性生活的女性要排出怀孕才行，其次要检查彩超看一看有没有子宫内膜息肉以及子宫内膜病变等导致的月经老是不干净，通常出现月经老是不干净有咖啡色，要考虑是不是无排卵型功血或者是子宫内膜增生症而导致引起的月经不干净。
人工流产手术之后月经出血明显变少，并且呈咖啡色，可能是人工流产手术，对于子宫内膜厚度的影响，要到医院做B超的检查，查子宫内膜的厚度是否正常，流产手术之后很容易出现子宫内膜变薄，这样就有可能会出现月经出血量的变化。
女性月经是由于卵巢周期性变化而引起的子宫内膜周期性脱落及出血，也就提示着月经是受体内性激素水平控制的。正常月经前和月经后都应该是没有血性分泌物的。如果在月经结束后持续出现咖啡色分泌物，提示有少量出血，有可能是黄体萎缩不全引起，需要检查女性激素水平来明确诊断，如果是黄体萎缩不全，可以使用性激素来调节。
月经老是不干净，呈咖啡色可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果是腹部受凉导致的，建议注意一般治疗，即适当休息，适当使用温毛巾热敷腹部，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果是宫颈炎导致的，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有头孢克肟胶囊、氨苄西林丙磺舒胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等。
对于月经第一天颜色呈深咖啡色是不正常的，正常的经血颜色为暗红色，刚开始量少，呈淡红色，然后逐渐加深。第一天颜色呈深咖啡色，考虑是有少量的出血，同时和腹部受凉、寒凝血瘀或肝气郁滞、气血不通有一定关系，可以适当地喝点红糖水，注意腹部的保暖。同时需要注意观察，有血块腹痛等，可适当地口服药物颗粒。
