治疗以手术为主，进行息肉摘除，宫腔镜子宫内膜切除术是唯一能够看清息肉蒂自根部切除的方法。切除基底层可预防其持续存在及复发机会。子宫内膜增生具有一定的癌变倾向，故被列为癌前病变。
一般来说，子宫内膜复杂增生属于恶性肿瘤，女性在女性中年纪大了，没有生育需求，需要进行子宫摘除。对于年龄较小，有生殖需求，或满足了生育需求，需要保存子宫的病人，可以通过服用黄体酮和地屈孕酮来进行治疗，因为孕激素具有抵抗雌激素和薄化子宫内膜的功能。第二种是将“曼月乐环”置于子宫腔中。曼月乐环可以在一定程度上产生左炔诺孕酮，起到一定的保护作用。
子宫内膜复杂性增生就有癌症的可能性，如果年龄比较大没有生育要求，可以做子宫切除手术。如果比较年轻，有生育要求，有保留子宫的要求，可以选择药物治疗和宫腔内放置曼月乐环。
子宫内膜复杂性增生过长只能通过药物来进行治疗了。子宫内膜复杂性增生，是无排卵性功能失调性子宫出血的，一种子宫内膜病理改变，只涉及子宫内膜腺体，为局灶型，腺体增生明显，拥挤结构复杂，由于腺体增生明显，使间质减少，出现腺体与腺体相邻层，背靠背现象，腺体上皮增生。
复杂性性子宫内膜增生主要是由于子宫内膜长期受雌激素的影响，而没有孕激素的对抗，使内膜腺体不规则增生导致的，有一定的恶变倾向。所以复杂性子宫内膜增生一定要抓紧给予孕激素治疗，必要时也需要给予诊断性刮宫或者采用手术治疗。
女性子宫内膜单纯性增生，局灶复杂性增生，常常是因为，子宫内膜在雌激素长期刺激下，没有孕激素对抗，不能发生周期性剥脱，而引起的异常增生，的治疗要根据女性年龄，对生育的要求等因素来进行具体治疗。女性可以先做诊断性刮宫，抑制子宫内膜再次增生，两个月以后进行复查。