第二代的试管主要是针对精子特别少，或者是精子的质量不好，这种来治疗的，一般对胚胎的发育是没有影响的。主要缺点是有可能会损伤到卵子质量，导致胚胎的分级比较低。根据自身情况在大夫指导下选择合理的助孕方案。
第一代试管婴儿是将精子与卵子放在一起，用精液直接跟取出的卵子培养，自己结合受精，第二代试管婴儿主要是针对男性原因引起的不孕不育输精管，少弱精问题，就是把精液进行处理，取出比较优质的精子再和卵子去结合。
第二代试管婴儿缺点与人为操作有关，一般胎儿都是自然受孕情况下出生。而再好技术皆存在缺点，具体缺点如下：试管婴儿操作时，将精子注入卵子可对精子内部造成稍许损伤，但肉眼无法看出；第二代试管婴儿受精率高，但优胚率、囊胚率及妊娠率，与新鲜试管婴儿差别不大；流产率约高于5%，高于体外第一代试管婴儿。而优点是成功率比传统技术要高。
所谓第一代第二代只是一个通俗的非正规的说法。在常规试管婴儿治疗过程中，患者把获取到的卵子和精子经过一定的处理后放在特定的环境中，在经过一定时间后精子和卵子会自然地结合在一道成为受精卵，过程患者俗称为第一代试管婴儿。但如果精子质量或数量异常，在经过一定时间后精子和卵子则不会结合在一道成为受精卵，这时患者需要使用一种特殊的方法让卵子受精，这就是单精子卵胞浆内注射术，也就是所谓的第二代试管婴儿技术。
第二代试管婴儿是男性不育是可以做试管婴儿的。就是把男性的精子拿出体外与卵子结合。做试管婴儿前多吃一些含锌的食物，注意补充营养，提高精子质量，服用精活素，融合十余种对精子有重要意义的物质，全面提升精子质量、正常形态精子数量、活动力、精液量、精液液化等精子指标，可以显著改善男性精子质量，受孕率提高12倍提高试管婴儿的成功率。
第二代试管婴儿应称为卵母细胞胞浆内单精子注射。与第一代试管婴儿的区别主要是精子和卵子结合的方。第二代试管婴儿主要由于男方精子质量不好，所以胚胎学家从有限的精子中选取质量好的精子，然后通过超细的针，在显微镜的帮助下，人工将精子注射到卵子内。精子的来源可以是新鲜或冻融的精子，也可以是附睾、睾丸穿刺取出的精子。