黄体酮注射液是天然的孕激素，所以肌注以后可以引起恶心、头晕及头痛的不良反应，长期使用还可能引起月经量的减少，或者是闭经，而且会导致体内水钠潴留，而引起体重增加。同时还可能会导致肝功能的异常。
长期打这款药物是不可以的，这款药是由卵巢黄体分泌的一种天然孕激素，在体内对雌激素激发过的子宫内膜有显著形态等影响，为维持妊娠所必需.临床常用于先兆性流产，习惯性流产，子宫内膜移位症，功能性子宫出血，痛经，卵巢功能低下所致的闭经或闭经原因的反应性疹断等。
黄体酮的作用是能够在月经的后半周期，促使子宫内膜腺体增生分泌，导致子宫充血，内膜增厚，为受精卵植入做好准备。同时还能减少妊娠子宫对缩宫素的敏感性，抑制宫缩，从而具有保胎的功效。同时与雌激素共同作用，还能够促进乳腺小叶和腺体的发育，使乳房充分发育，为泌乳做准备。而黄体酮的副作用就是可能会引起恶心、呕吐等胃肠道反应，同时还可能会导致体内液体的潴留而导致水肿，还会引起头晕等。
怀孕吃黄体酮的副作用有可能会导致出现头痛以及头晕的症状。
在怀孕期间如果身体中并不缺乏黄体酮，但是过量的补充之后很可能会对身体造成一定的影响，也有可能会导致出现头晕和头疼的症状，还可能会出现恶心和呕吐等现象。如果缺乏黄体酮，可以适当的补充，能够起到保胎的作用，但如果不缺乏，尽量不要盲目的补充。
期间需要做好自身的防护工作，尽量不要过度劳累。
突破性出血，阴道点状出血，体重增加或减少，宫颈鳞柱交界改变，宫颈分泌物性状改变，乳房肿胀，恶心，头晕，头痛，倦怠感，发热，失眠，过敏伴或不伴搔痒的皮疹，黑斑病，黄褐斑，阻塞性黄疸，肝功能异常。
闭经女性只要不是泌乳素升高引起的，一般会先给予黄体酮进行试验性治疗。使用黄体酮后，如果月经来了，则说明存在孕激素不足，可以继续使用，如果月经没来，就可能是其他原因引起的闭经，包括精神刺激、体重下降、运动量过大、垂体肿瘤、卵巢早衰、子宫内膜破坏等，需要进一步检查和治疗。