附件囊肿通常指卵巢囊肿或者输卵管系膜囊肿，由于囊肿的大小、性质以及伴随症状不同，治疗方式就要因人而异。如果检查考虑是输卵管系膜囊肿，而且女性有反复的下腹部疼痛，考虑行手术进行囊肿剥离术，如果检查彩超发现是卵巢上的囊肿且小于三厘米以下，但没有任何不适症状，可以不做任何的处理治疗，而是随访复查彩超看囊肿的大小变化情况。
卵巢附件区的囊肿，如果是在5厘米以内可以暂时观察，可以在2次月经干净以后再重新复查。因为很多卵巢囊肿是功能性的，也就是有可能是卵泡囊肿或者黄体囊肿，一般2个月以后就会消失。如果观察2个月，囊肿继续增大或者没有消失，就是卵巢肿瘤，需要做手术。一定不要做剧烈活动，因为卵巢囊肿容易出现扭转。一旦出现扭转，必须要急诊做手术，会出现剧烈的腹痛，时间长了会引起卵巢的坏死，影响卵巢的功能。
如果患有卵巢囊肿，并且发现怀孕，这时候就不需要采取手术治疗了，这种囊肿本身是属于一种良性的囊性改变，如果没有突然变大很多，或者挤压到子宫，并且不影响胎儿发育，是不会造成其他风险的。要进行常规孕检，孕前三个月补充叶酸就可以。
一般情况下，孕妇怀孕时附件囊肿有以下治疗方法：
附件上的囊肿一般就是指的是卵巢囊肿。卵巢囊肿是一种良性病变，有些生理性的囊肿与激素水平有关系，会在月经后自行消失。有些囊肿不能自行消失反而会增大，这种情况一般需要手术处理，一般考虑是腹腔镜下手术挖除。
建议孕妇在孕期注意饮食均衡，多吃新鲜的水果和蔬菜，以此来补充怀孕期间所需要的各种元素，保证胎儿的健康。
附件囊肿需要看囊肿有多大，需要进一步检查囊肿内有没有实性成分。如果囊肿超过5公分就需要手术，如果不到5公分，就需要化验血和妇科检查，如果检查不是恶性就可以暂时观察，1-2个月再复查是否有增大的趋势。
对于卵巢囊肿的治疗，一般措施是采取手术治疗月经异常与附件囊肿直接相关。患者应该注意休息和及时对症治疗。如果出血太多，患者应该及时选择一些止血药。同时，做b超检查，看看卵巢囊肿是否变大或有其他变化。