通常是不会发生癌变的，子宫颈囊肿绝大多数是子宫颈的生理性变化，是子宫颈转化区内麟状上皮取代柱状上皮的过程，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口造成的分泌物阻塞。子宫颈局部损伤或慢性宫颈炎使腺管口狭窄，也可以形成子宫颈囊肿。
宫颈囊肿切除后易复发，但不一定会癌变，每年做一次宫颈的检查，只要没有宫颈癌前病变，问题不大，宫颈囊肿可以不治疗。囊肿属于良性病变，会越来越大，应及时就诊，积极配合医生进行合理的治疗措施。
宫颈囊肿一般为良性、炎性反应，不会癌变。如无白带异常或反复的阴道炎症，可不用治疗。如囊肿较大或伴有宫颈糜烂，出现腰酸、腹部坠胀、白带增多有异味或反复发作的阴道炎症，如果囊肿太大或者多发性的就要考虑去医院治疗。
宫颈囊肿是慢性宫颈炎症导致的，也成为那是腺囊肿，宫颈囊肿，一般不会导致宫颈癌的，如果是有合并有HPV的感染，那么就会增加宫颈癌的几率。要根据妇科检查的结果就进一步检查，比如宫颈筛查，HPV检查，确定之后，根据情况对症采取治疗措施，注意卫生，保持清洁。
宫颈囊肿同宫颈糜烂、宫颈息肉一样，是慢性宫颈炎的一种表现。宫颈糜烂愈合过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或伸入腺管，将腺管口阻塞；腺管周围的结缔组织增生或瘢痕形成压迫腺管，使腺管变窄甚至阻塞，腺体分泌物引流受阻，滞留形成的囊肿叫宫颈潴留囊肿。
