卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的表现。手术复发的几率比较高，可以考虑先吃药等肿瘤变小以后，再考虑手术，手术后再配用药，才能够达到很好的治疗效果。中药效果甚微，根据情况可以采用超声引导下介入治疗，细针穿刺囊肿，抽出囊液，打药治疗，使巧囊萎缩消失，不手术，不住院，保全卵巢，随治随走。
饮食上可以随便吃。巧克力囊肿的治疗一般是选择手术，术后打针防止巧克力囊肿复发，所以巧克力囊肿跟饮食没有关系的，它的形成原因就是内膜移位了，导致巧克力囊肿发生，所以饮食上可以随便吃，不影响巧克力囊肿的。
巧克力囊肿怎样食疗，巧克力囊肿损害女性卵巢正常功能，若不及时治疗很容易诱发不孕症出现，尽要治疗。巧克力囊肿多吃一些羊血、螺狮、淡菜、乌贼、荠菜、藕、蘑菇等食物，对治疗进程有一定帮助。
巧克力囊肿病人能吃羊肉，但是一定要注意食用量，不能暴饮暴食，养成少吃多餐的习惯比较好。另外巧克力囊肿病人还应该忌辛辣刺激和油腻油炸的食物，要多吃清淡的食物还有多吃瓜果蔬菜。
巧克力囊肿可以采用药物治疗和手术治疗两种方式治疗，治疗时一般要根据年龄、对生育的要求、囊肿的大小、病情的轻重来决定是采用药物治疗还是手术治疗，保守性的治疗主要是保留卵巢功能的治疗。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上，周期性的生长发育萎缩而导致。对于轻度的卵巢巧克力囊肿患者，在经期出现腹痛的时候，患有巧克力囊肿的患者可以选择口服避孕药，避孕药是最早用于治疗巧克力囊肿的激素类药物。