从循证医学的角度来讲，试管婴儿出生的孩子和自然怀孕分娩的孩子没有太大的差别，但如果是二代试管，也即是单精子注射的方式分娩的孩子，其子代出现尿道下裂的风险可能会略微增加。
试管婴儿长大后没有弊端，与正常的胚胎发育出生的婴儿没有区别。试管婴儿采用的都是健康的精子和卵子，不会出现智力低下的问题。试管婴儿的胚胎是经过严格的筛选的，试管婴儿已发展出三代，第三代试管婴儿可以做基因鉴定，可以排除有基因遗传性疾病的胚胎，确保在移植前的胚胎是正常的。
研究表明，试管婴儿在出生后与正常怀孕的孩子，在是否有缺陷以及认知能力、行为能力上没有什么不同，所以并无弊端。虽然，试管婴儿与其他孩子并无差别，但是对于做试管婴儿的女性，可能有一定影响。
试管婴儿出生时体重过轻或者带有缺陷的风险很高。试管婴儿先天畸形等缺陷会增多，试管婴儿会存在先天缺陷的可能性是普通婴儿的两倍到四倍。缺陷包括心瓣畸形、唇颚裂，以及肠脏或食道发育不良，以致消化系统异常等。
每个月自然受孕的几率是25%左右，所以50%的夫妻会在备孕的半年之内怀孕，80%的夫妻会在备孕的一年之内怀孕，放松心情。做试管婴儿的成功率也是40~%50%左右的，不用太担心做试管婴儿的宝宝和正常宝宝是一样的。
具有很大的遗传风险。试管婴儿出生的孩子和自然受孕出生的孩子并没有什么差别。试管婴儿治疗出生的孩子在出生缺陷，成长发育和认知能力上，与自然出生的孩子并没有什么不同，但也不是说经过试管婴儿技术出生的孩子就健康聪明。