副作用会导致少量出血，阴道、宫颈黏膜的疼痛，有个别人对这个药物有过敏反应，可能会导致阴道疼痛、瘙痒、不舒服，不过，很少发生过敏。主要是治疗宫颈炎症和宫颈糜烂导致的接触性出血。
消糜栓的副作用可能会出现用药部位红肿、瘙痒、烧灼感。在用药期间忌食辛辣、生冷、油腻的食物、禁止同房、禁止内服、未婚女性不宜使用。在用药部位如果出现烧灼感等不适时应停用。
修正消糜栓用后排出这是一种正常的现象，它主要用于治疗宫颈糜烂、宫颈炎，治疗效果还是不错的，具有消炎抗菌、去腐生肌的功效，能够消除炎症，加速老化的坏死组织的代谢，促进创面的修复，使宫颈逐渐变得光滑。
阴道内放置消糜栓后出现死皮状异物排出，属于正常的生理现象。随着药效的发挥，病变部位的坏死组织会发生脱落，与溶解的药物以及阴道内的炎性分泌物等混合后排出就形成死皮状排出物。
消糜栓可以治疗宫颈炎和阴道炎症，用这个药物以后，阴道分泌物会增多，排出褐色的分泌物，主要是药物残渣，还可能会排出像死皮一样的东西，是药物残渣，有一部分人对它过于敏感，容易引起瘙痒，轻微的疼痛，最好观察看看，如果出现异常瘙痒，疼痛，可能是对药物过敏，最好及时停药，注意局部用温水清洗。
排出异物一般要五到七天的时间，消糜栓具有消除炎症，去腐生肌的作用。对于患有各种阴道炎及宫颈炎的患者，外用消糜栓后会逐步的将阴道和宫颈处的，有菌的白带及宫颈上有炎症的表皮进行脱落，并促进新生的上皮细胞生长，这一过程大约需要五天至七天才能够将脱落的组织排泄出来。