卵巢囊肿48mmx36，手术时是不是要切除卵巢取决于卵巢囊肿的性质。如果卵巢囊肿是良性的，是不需要切除卵巢的，只需要将卵巢囊肿从卵巢中剔除就可以了。但如果卵巢囊肿是恶性的，不仅需要切除卵巢，还需要切除子宫，输卵管，然后进行淋巴结的清扫。而卵巢囊肿性质的判断需要结合核磁共振检查、超声检查，以及术中冰冻病理共同决定。
卵巢囊肿为良性，一般不需要切除卵巢；卵巢囊肿为恶性，则需要切除卵巢。具体情况分析如下：
如卵巢囊肿为良性，只行卵巢囊肿剥除术，保留卵巢组织，一般不用切除卵巢。在手术时，卵巢囊肿一般都会送术中快速病理，如提示为卵巢恶性肿瘤，一般需要切除卵巢，并且还需要根据病理类型、恶性程度高低、年龄、有无生育要求等，来确定手术范围，可以进行患侧附件切除，包括卵巢、输卵管，也可能需切除全子宫加双侧附件、盆腔淋巴结、大网膜、阑尾。
卵巢囊肿是不需要切除卵巢的。卵巢对于女性非常重要，如果完全切除一侧卵巢，虽然还有另一侧卵巢，但是如果是另一侧卵巢功能丧失或者出现囊肿，就给女性会带来很大的困惑，会出现更年期提前的症状。所以临床上对于卵巢囊肿的手术，只要单纯的将囊肿剥离下来，然后缝合剩余的卵巢组织就可以。
卵巢囊肿是不需要切除卵巢的，因为单纯性的囊肿多数属于良性的，并且如果平常不大，都不用做手术。如果很大的，大约5-6cm，才需要进行手术治疗。只需把单纯性的囊肿剥出来。
卵巢囊肿是妇科常见病，卵巢囊肿是否需要进行手术切除，需要专业的医生进行判断，借助B超、CT、核磁等影像学检查、实验室检查结果初步判断肿瘤性质。卵巢单纯性囊肿，直径＜5公分，可观察2-3个月，如自行消失属于功能性囊肿，如持续存在、继续生长，则需手术治疗。
卵巢囊肿并不一定需要手术切除。可以做B超明显大小后再确定方案的。如果较小可以不必做手术，正常治疗即可。超过五厘米的囊肿才是需要考虑做手术的，因为囊肿太大，药物治疗没有效果，同时持续增大，可能会发生疼痛，内出血，风险就会比较大。