主要病因包括：①食滞：小儿脏腑娇嫩，加上饮食不知饥饱，易伤及脾胃，造成“食滞”，“脾胃不和”，运化功能失调，出现厌食。②脾湿：历夏季，暑湿之气偏盛，湿邪内侵，脾被湿困，运化受阻，引起厌食。③先天不足、元气虚弱：因早产或其他原因，使小儿发育不成熟，小儿先天元气不足，肾气不充，脾胃功能虚弱，运化无权，发生厌食。④脾胃虚弱：因重病或久病，正气亏乏，伤及脾胃，脾失健运，引起厌食。
小儿厌食症主要缺锌有一定的关系的。厌食症因为长时期食欲不振、看到食物也不想吃、甚至拒吃，这种情形连续两个月以上，如此，才符合所谓的“厌食”。小儿厌食症首先要排除孩子有无感冒或内科慢性疾病、消化道疾病等疾病。给孩子吃些补锌的。
宝宝厌食症是指长期的食欲减退或消失、以食量减少为主要症状，是一种慢性消化功能紊乱综合征，是儿科常见病、多发病，1-6岁宝宝多见，且有逐年上升趋势。常用的推拿方法是清板门100次、逆运内八卦100次、推四横纹100次、捏脊6遍、退六腑100次、揉合谷100次。
注意饮食合理搭配。小儿生长发育所需的营养物质要靠从食物中摄取，但对这些营养素的需要并不是等量的，注意各营养素间的比例，以求均衡饮食。每天不仅吃肉、乳、蛋、豆，还要吃五谷杂粮、蔬菜、水果。每餐要求荤素、粗细、干稀搭配。
一般来说，小儿厌食症可以通过以下方式预防。具体分析如下：
第一，改善饮食习惯，尽量避免吃油炸，膨化食品，巧克力等高卡路里食物，可以吃新鲜的水果和蔬菜。
第二，要注意小儿有没有缺锌，因为锌会对味蕾的细胞再生及分泌的粘多糖产生一定的抑制作用，从而引起食欲减退、食欲减退、食欲减退，需要适当补充牡蛎、扇贝、蛋黄等含锌量较为丰富的食物。
日常生活中，家长应当注意保持环境清洁，尽量减少在粉尘、烟雾及其他刺激性环境中停留。