脑炎后遗症的治疗主要鼓励病人做主动锻炼。尽量多活动，让患肢得到运动，利于功能的恢复。药物疗法。理疗是应用电、光、声、热等物理因子预防或治疗疾病脑炎后遗症，理疗能够调整血液循环，改善新陈代谢，提高自身免疫功能，调节神经系统功能，促进组织修复等作用，应用比较广泛。
患脑膜炎时，脓性渗出物易堵塞狭小孔道或发生粘连而引起脑脊髓循环障碍，产生脑积水。常见于治疗不当或治疗过晚的病人，尤其多见于新生儿和小婴儿。除因呕吐、不时进等原因可引起水、电解质紊乱外，还可见脑性低钠血症。出现错睡、惊厥、昏迷、浮肿、全身软弱无力、四肢肌张力低下、尿少等症状。
一般情况下，轻微脑膜炎是否有后遗症需根据实际情况来判断，具体内容如下：
脑膜炎是一种由各种病毒、细菌、结核、真菌等感染所致的疾病。其主要症状为发热、呕吐、意识障碍及脑膜刺激症状。因患儿年龄较轻，有少量吐奶、前突饱满、头围增大等表现。因此，需要进行腰穿脑脊液的检测，轻度的脑膜炎一般表现较轻，但预后较好，早期发现及时治疗，一般不会留下任何的后遗症，治疗时间较晚就可能存在后遗症。
脑炎后遗症常见的症状是精神迟钝，抽搐，大脑瘫痪，小脑畸形，智力低下，运动障碍，脑积水等。神经异常的表现多有发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，重者则大脑、丘脑下部、底节、脑干、小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
脑炎后遗症是指脑炎治疗后，还残留有神经、精神症状的疾病。病毒性脑炎（简称病脑）是由各种病毒引起的一组以精神和意识障碍为突出表现的中枢神经系统感染性疾病。
完全恢复的可能很小。由于脑膜炎合并了脑组织损伤，脑细胞损伤与其他组织损伤不同，脑细胞损伤不能再生和修复，遗留的运动，感觉功能障碍，目前没有很好的治疗措施和方法。