儿童嘴巴里长口疮需要外用药物治疗。治疗方法主要是对因治疗，对症治疗止痛。可以使用碘伏溶液漱口。外用口腔溃疡散等，不吃辛辣食物，注意口腔卫生。平时需要注意饮食调理，均衡饮食，不挑食。
口疮叫做疱疹性口炎，是由于唇部周围皮肤黏膜受到疱疹病毒的感染，导致引发局部皮肤出现针尖样水泡成簇出现，表现为局部皮肤发痒、疼痛、结痂、糜烂、脱皮等现象。局部可以涂抹抗病毒的软膏进行治疗，对病毒具有较好的抑制作用，同时促进疱疹的修复。
婴儿长口疮，考虑是存在口腔溃疡，有以下几种治疗措施:第一种，建议多喝水，清洁口腔内壁，适当的喷洒西瓜霜喷剂，也可使用维生素c片或者克菌定含片敷于溃疡处，可以起到很好的治疗效果。第二种，考虑是由于缺乏维生素引起的，适当的补充复合b族维生素，局部涂抹口腔溃疡散，注意局部卫生，每次奶瓶要消毒，给孩子勤洗手。
嘴上长有口疮，可以适当的服用一些消炎下火的药物，一般长口疮，主要是因为体内有上火导致口腔出现炎症引起的现象，在使用药物期间一定要注意多喝水，还要保证口腔部位清洁，不要吃辛辣等刺激性的食物。
一般来说，宝宝生口疮应该根据实际情况来处理。
宝宝生口疮首先要对孩子的口腔进行细致的检查，以确定其周围的牙齿有没有锋利而不平滑的切口。在日常生活中避免让孩子食用酸性、含盐的食品，给宝宝用的东西尽量要一次性，奶嘴要高温烫过才能使用。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，增加抗病能力。