小孩感冒咳嗽，不建议使用灌肠，除非是直肠处使用的药物，例如：布洛芬或醋氨酚栓。
不推荐进行灌肠，主要是因为灌肠的药量控制不住，可能导致治疗的效果不佳，其次会导致肠粘膜受损，肠道菌群紊乱，甚至出现肠穿孔，肠出血，肠坏死等不良反应。一般的感冒和轻度的咳嗽都是可以自行治愈的，但是出现了呼吸道感染，最好是服用一些药物。
直肠黏膜非常娇嫩，反复灌肠，对直肠的刺激非常明显，长时间刺激，容易导致脱肛、痔疮等，因此，虽然直肠给药比较方便，但在规范的医院，临床上一般不作为首先得给药途径。给药的药物成分复杂：很多诊所以中药为幌子，号称没有毒副作用，其实际上内部添加很多的抗生素甚至是激素，对宝宝的身体健康带来很大的危害，更需谨慎选择。
小孩发烧的时候进行灌肠治疗，主要的作用是进行退烧，不仅退烧的速度快，而且退热的持续时间也比较长，对于孩子的胃肠黏膜损伤也比较小。灌肠的时候，如果操作比较粗鲁，容易造成孩子直肠黏膜或者是肛门损伤，还有可能会感染。操作的时候要轻柔。
孩子不建议灌肠，孩子还没有发育好了，灌肠，会导致伤害，孩子的肠道功能。影响肠道功能的消化，虽然发烧，用灌肠效果好，还是不建议用这种办法。而且多种药物同时灌肠，药物之间会发生反应，也会对孩子造成一定伤害。
小孩做灌肠不好，灌肠对人体有一定的好处，灌肠是从肛门经直肠插入结肠灌注液体，可达到通便排气的治疗方法，能够刺激肠蠕动，可软化达到清除粪便的作用。也具有稀释肠内毒物，减少吸收，可清洁肠道，为某些手术做准备。
考虑跟支原体、病毒这些感染有关系的，灌肠是通过肠道粘膜吸收的，输液是直接静脉输入，吸收更好，从吸收来说还是输液比较好，但是灌肠对人体伤害较小如果不严重的可以使用灌肠、口服药物治疗，如果这些效果不行，再考虑输液治疗比较好，使用抗感染、止咳这些药物治疗。