纯母乳喂养婴儿腹泻家长应及时将宝宝的大便送检：平时在家中备上一个医院化验便常规使用的便盒，不要刮取尿不湿上的大便，留取大便后需要在半小时以内送检，如果大便化验可见白细胞，多为侵袭性细菌感染，当抗生素治疗效果不好，或病情反复时，应及时做大便培养。大便化验未见白细胞，多为病毒感染或非感染性腹泻，最严重的是脱水及电解质酸碱失衡。
母乳喂养的婴儿容易受妈妈饮食影响出现大便异常，婴儿现在的情况和妈妈吃东西会有关系。建议妈妈先饮食规避一段时间，不要吃生冷寒凉的食物，婴儿肚子不要受凉了，如果宝宝大便还是不好，可以化验大便看看，孩子大便好了，可以添加辅食了。
这种时候要立刻暂停母乳，然后母亲调节一下饮食，再给宝宝进行母乳试试看。产生这个现象的原因是因为母乳中含有的脂肪含量比较高，而且母亲如果吃了生冷寒凉的食物，就会导致母乳中含有的寒凉物质比较多，宝宝食用了母乳以后腹泻。在给宝宝哺乳阶段，母亲应该注意避免食用生冷寒凉的食物。
如果要是严重，还是要去医院然后进行治疗。当然可以服用一些药物。它主要是针对小孩儿脾气虚弱。上吐下泻。多补充有营养的物质。睡眠也要保持充足，这些可能会增强宝宝的免疫力。
一般比情节较轻的宝宝吃母乳拉稀无需治疗，妈妈可以继续哺乳；如果宝宝拉稀严重，应该及时带宝宝到医院进行治疗，一般可以使用中药治疗，同时也可以使用针灸的方法进行治疗，效果很好。
3个月宝宝腹泻可遵医嘱口服肠道益生菌、蒙脱石散治疗。
3个月宝宝腹泻与肠道菌群失衡有关，调节肠道菌群失常，家长可以在医生指导下给宝宝口服肠道益生菌。口服益生菌能够提高肠道抵抗力，增加肠道中有益菌的存在，促进肠道功能恢复，缓解腹泻，提高宝宝的免疫力。
腹泻比较严重的患者适当服用蒙脱石散，可以吸附肠道中的病毒和细菌，改善肠道细胞的吸收和分泌功能。