新生儿母乳喂养拉肚子可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。
新生儿母乳喂养腹泻，通常多因母体饮食不当引起。母乳中含有大量的维生素和蛋白质以及微量元素，这些营养物质都是对宝宝健康非常重要的成分。因此，母乳喂养过程中，妈妈要特别注意饮食，不能随意食用，不然肯定会造成儿童消化功能紊乱，继而发生腹泻。因此在母乳充足时，就应该尽量保证孩子摄入足够的食物，这样才能有效预防婴儿拉肚子。症状严重者，可让宝宝吃妈咪爱或益生菌调理肠胃，那么，平时就应该让孩子喝更多的水，帮助减轻患儿疾病。
母乳喂养的宝宝拉肚子的情况，可能是由于着凉的情况导致的，或者是母乳出现了问题。在这段时间内给宝宝注意腹部的保暖，尽量避免着凉。然后平时一定要注意饮食安全，多喝水。
刚出生的宝宝拉肚子不需要特殊处理的，只需要密切观察即可。观察宝宝的精神状态，吃奶情况，大便是否有恶臭，大便是否有粘液脓液血液等情况。如有以上问题应当及时就诊检查治疗的。
宝宝拉肚子是婴幼儿最常见的胃肠道疾病。宝宝拉肚子的根本原因是免疫功能差，对病毒细菌的抵抗力弱，当肠道受到感染时，便很容易感染拉肚子。要适当短期禁食，一般不超过8小时。也要适当补液，也要少食多餐，必要时也可以让宝宝服胖得生。
宝宝吃母乳拉肚子可以服用助消化的药物进行治疗。如果宝以前吃奶粉改喂母乳以后经常拉肚子，说明对母乳不适应，有可能是对母乳过敏，也有可能是消化不良，看以后能不能适应母乳，如果不能就只能吃奶粉。
母乳性腹泻：母乳喂养引起腹泻，可能是母乳中的前列腺素含量较高，该物质促进小肠平滑肌运动，增加水和电解质的分泌而产生稀便。引起母乳性腹泻也可能是小儿对乳糖不耐受，体内缺乏乳糖酶。