一般情况下，婴儿打完乙肝疫苗后发烧可以采用以下方式进行治疗：
婴儿打完乙肝疫苗后发烧，首先是体温不高于38.5℃可以进行物理降温。用冰或者冰毛巾在头上进行降温，可以按照酒精的蒸发和吸收热量的原则，然后用热水洗澡，或者用退热贴。如果体温超过38.5℃，可以遵医嘱口服布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂等药物进行治疗。
打了乙肝疫苗后轻微发烧多喝水观察就可以，但是发烧严重，体温超过38.5度°，并且伴有全身其他症状要尽快就诊，可能是疫苗引起的不良反应，也可能是身体其他疾病感染引起的发烧。不要用抗病毒药，以避免影响疫苗的作用。
注射疫苗后，可以有轻度的发热，多喝热水就可以退热。如果用疫苗后，出现严重的高热，则要考虑是巧合了病毒性感冒等疾病。有高热的时候，要做血常规和咽部的人工检查来判断，如果是巧合了病毒性感冒，可以用药物治疗。
注射乙肝疫苗后如果出现发热症状，一般以低热为主，可以通过物理降温，多喝水，观察体温变化，一般1-2天后体温会逐渐下降。
如果出现高热，或者出现恶心、呕吐、精神差等症状，建议及时就医。目前大多数注射疫苗都不会有任何不适症状，只有少部分疫苗会出现相关的不良反应，不过大多数情况都比较轻微，不需要特别处理。
乙肝疫苗孩子发烧39需要去医院的儿科检查一下，排除有无受凉感冒或过敏性紫癜的情况。给孩子多喂开水，饮食上吃些好消化，忌辛辣和凉的食物，这段时间多休息，检查清楚在及时配合治疗一下。
注射疫苗后常见的副作用是发烧，心跳加快，注射部位红肿疼痛，恶心呕吐腹痛腹泻等。如果体温低于38.5度，可以多喝水，不需要吃退烧药，观察。如果体温高于38.5度，就要服退烧药，如果伴随鼻塞，流涕，咳嗽，说明是感冒了，对症吃感冒药即可。