如果是蛛网膜先天性囊肿为良性病变，可与胚胎发育异常等有关，对于囊肿较小、无症状者可以暂时观察，定期复查，如果囊肿较大或出现压迫症状，如头痛、头晕、恶心、呕吐等情况者可进行手术，如囊肿一腹腔引流、囊肿切除等。
先天性肾囊肿不严重。是肾脏一种先天性异常。双侧肾脏披髓质均可累及，但在程度上可不同。先天性肾囊肿瘤病的病因是基因缺失。婴儿型先天性肾囊肿瘤病是常染色体隐性遗传。
头部囊肿是一种良性疾病，不是严重问题。位于颅外或颅内，颅外一般是头皮皮脂腺囊肿或颅骨囊性肿物，如有不适可以手术切除治疗。颅内囊肿一般是指蛛网膜囊肿，是脑脊液样囊液被蛛网膜包裹成囊状的表现。
先天性囊肿的治疗，要看囊肿的具体位置和，如果位置不重要，对人没有影响是不用治疗的。而如果位置比较重要，对人的健康产生影响，可以通过手术切除，所以具体要看囊肿的位置。
头部囊肿来讲，其实一定要明确诊断，包括蛛网膜囊肿、垂体囊肿、松果体囊肿以及其他的囊肿性质的改变。单纯的从一个头部囊肿来讲，并不能完全说明到底是严重还是不严重。但是对于颅内囊肿是一个明显的占位效应，会逐渐的压迫周围的神经和组织，造成一系列的症状。
通常情况下，先天性肝囊肿是胚胎期肝内胆管和淋巴管发育障碍所致。具体分析如下：
先天性肝囊肿是由于肝内迷走胆管或胚胎期肝内胆管和淋巴管发育障碍引起的，成人以女性多见，常发生于40岁以上，小儿很少发生，但也有零散报告，发生于肝右叶者比左叶多，且以孤立性肝囊肿多见，临床表现主要有右上腹疼痛、肝大或腹部肿块等，部分可有黄疸。建议患者去医院检查，明确病因，然后对症进行治疗。
