先要确定是感染性腹泻还是非感染性腹泻，建议做大便常规检查，确定大便中有没有白细胞。如果是有白细胞，就考虑感染性腹泻。如果没有白细胞，就是非感染性腹泻可能。
引起原因不清，可能与饮食不当引起的胃肠道炎症有关系。另一方面可能是宝宝饮食过量导致的消化、吸收不良有关系。需要带孩子到医院就诊，在医生的进一步检查下，明确引起孩子发烧拉肚子的原因，然后再进行积极的对因和对症治疗，也可使孩子的发烧、拉肚子尽快得到控制。
腹泻后发烧，可以通过以下这些方式进行治疗：
腹泻后发烧可能与肠道炎症有关。发热的病因可以通过血液和粪便的常规来进行。如有细菌感染，出现血象升高，可以口服头孢、喹诺酮等抗生素。体温高于38℃5，可以口服消炎消炎止痛药，也可以选择酒精擦浴、退热贴等物理治疗。还有就是要及时的对原发性腹泻进行治疗，如果出现腹泻症状，可以口服蒙脱石散等止泻药。
一般情况下，宝宝拉肚子有点发烧可以进行饮食治疗、药物治疗、物理治疗等，具体分析如下：
如果宝宝腹泻的频率比较低，体温也没有那么高，出现呕吐等情况，可能是肠胃着凉，可以在医生指导下服用藿香正气水，按照说明书上的提示服用；要避免进食难消化的食品，多喝一些米粥；如果宝宝的体温不高于38.5℃，可以用思密达来进行物理治疗，可以用热敷敷退热贴，也可以用温水擦拭湿宝宝的额头、腋下、手脚。
要弄清楚是什么原因导致的腹泻发烧，可以化验血常规和大便常规，大便常规发现白细胞提示有细菌感染，要到正规医院接受治疗，体温大于38.5可使用退热药，体温不是很高可以采取物理降温帮助宝宝散热，发热期间可以给宝宝多饮水以补充水分。腹泻期间要注意宝宝的饮食。人工喂养的奶粉可以比平时稀点，促进宝宝的吸收。
宝宝拉肚子伴有发热如果只从血常规上就判断是病毒感染引起的腹泻并不是太准确的。可用退热贴退热栓温水擦浴等物理方法降温，而且一般病毒感染病程也不会太长。现在抗病毒治疗无效不能排除细菌感染，完善大便常规和培养来明确诊断。