一般来说，主要是因为病毒细菌侵入身体，诱发呼吸系统和肠胃部感染，从而产生发烧。除此之外还有以下几个原因:一，不明原因发热，一般来说，临床上还采用发烧的狭义意义，发烧时间连续超过三个星期，患儿体温超过38.5摄氏度，经过细致的查问病史，身体检查以及寻常的体验检查，仍然不能确定发病原因。二，非感染性发热，不是由各类传染疾病诱发的，而是由各式炎症导致的身体体温调节中枢的混乱，或者是各式原因诱发的身体产热较多、放热较少，从而产生身体体温上升，异于正常体温的情况。
小孩反复高烧三十九度是由于呼吸道感染导致的，包括上呼吸道感染，如扁桃体炎，疱疹性咽峡炎，口腔溃疡。下呼吸道感染，如支气管炎，肺炎。或是消化道感染，神经系统感染，病毒性脑炎或者化脓性脑膜炎这两种疾病在发烧的同时合并有精神萎靡。
小孩反复高烧是病毒性的，病毒性的感冒发烧就是易反复发烧的，可给孩子查支原体抗体滴度，建议查血常规，crp等检查。发烧是很多疾病都有的症状，一定要把引起发烧的病治好了，发烧才能真正消退。
孩子反复发烧主要是抵抗力差。孩子不按时间吃饭、睡眠不足、营养不良等，都可能导致抵抗力差，从而引起反复发烧。此外，发烧的本质是病毒感染，但不能解决病原体感染的问题，所以就会反复发烧。
婴儿反复高烧是病毒感染引起的病毒血症，急性期体温波动在39摄氏度至40摄氏度之间，随着病程进展出现咳嗽、流鼻涕、鼻塞等症状，如果婴儿全身状况良好，可以口服清热解毒的中成药。
小儿持续发烧不退，一些特殊的病毒或细菌感染。如果是一些平时不常见的病毒或者细菌感染以后孩子发烧可能会出现长期不退的情况。这个时候就应该抽血，进一步明确检查了。