手足口病用酒精消毒是无效的,因此不能用酒精来消毒。大人和儿童都要正确洗手,饭前便后、外出后要用肥皂或洗手液等给儿童洗手。洗手时一定要做到手与肥皂泡沫的接触时间至少三十秒,用流动水冲洗,50℃就能够杀死手足口病病毒。如果衣物、被子在太阳底下暴晒一天,基本可以杀死病毒。除了酒精无效外,其他漂白粉、八四消毒液等含氯的消毒液基本都能够有效地杀死病毒。
手足口日常消毒可以使消毒液消毒。孩子的碗、筷子、玩具需要用热水煮沸起到消毒的作用。手足口患者接触的床上用品，衣物应该彻底清洗以后放到阳光下暴晒，如果家里有紫外线灯，也可以使用紫外线灯照射一小时。
手足口病可以使用艾叶清洗双手，但一般并不建议在手足口病期间用水煎剂洗澡，即使用温开水洗澡也不是太建议。仅仅建议用艾叶的水煎剂来外用在有疱疹的部位，主要是手足的部位。
手足口病主要是由肠道病毒感染引起的，有传染性，在消毒的时候是需要避免密切接触的，防止发生交叉感染等，另外一定要配合医生，还要注意保持出疱疹部位的清洁，家里面要注意消毒，注意通风。
食具、饮具，首选热力消毒的方法，如选用红外线或者煮沸消毒的方法。衣服、被单煮沸20分钟，或者用消毒剂作用30分钟，不能用水洗的物品，可以放到阳光下曝晒，也有很好的效果。衣服可以在阳光下曝晒，室内需要保持通风换气。
手足口病毒不耐热，对紫外线和干燥都比较敏感。病毒在50度时，被迅速的灭活，而在零下20度可以长期存活。所以，家里可能被污染的东西能够加热煮沸消毒的物品尽量煮沸消毒，不能够煮沸加热的，可以放在阳光下暴晒，紫外线消毒。