在治疗早期应该以干燥止痒为主，应当保持手足干爽清洁，家长要做好孩子的心理工作，不要有过重的心理压力，期间要格外注意孩子的饮食，多给孩子吃些清淡的食物，避免油腻，多吃一些水果和蔬菜，保持大便通畅。
初期的症状会发现在唇黏膜或者舌头上或者上腭出现小红点，逐渐小红点会慢慢变大，小红点的数目是数不清的，像满天星一样。逐渐小红点会变成白色，宝宝有可能会伴有发热、哭闹情况的出现。
疱疹性咽峡炎是一种急性传染性、发热性疾病，是由许多A组柯萨奇病毒，偶尔也有其他肠道病毒所引起，其特点为疱疹性溃疡性粘膜损害。多喝水，注意手足部皮疹情况，排除手足口病。
宝宝喉咙有疱疹可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果存在发烧，家长可以用冷毛巾擦洗宝宝的全身，也可以用冰袋冷敷宝宝的额头，这样有利于缓解症状。
2.使用药物：为了促进病情恢复，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有利巴韦林颗粒、蒲地蓝消炎口服液、对乙酰氨基酚颗粒、炎琥宁注射粉针、利巴韦林注射液等。
一般来说，宝宝疱疹可能是以下原因引起的。
疱疹主要是由人疱疹病毒感染所致的皮肤疾病，主要是以皮肤、黏膜改变为主，患者出现局限性损害。宝宝疱疹可能是柯萨奇病毒感染，也可能是肠道病毒感染引起来的，或是水痘-带状疱疹病毒感染引起的，需要积极治疗。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，增加抗病能力。